아프리카

네이처(2023)이 기사 인용

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HIV-1은 여전히 ​​세계적인 건강 위기로 남아 있으며1, 치료법에 대한 새로운 표적을 식별할 필요성을 강조합니다. 여기에서는 아프리카의 불균형한 HIV-1 부담과 현저한 인간 게놈 다양성을 고려하여2, 우리는 게놈학을 위한 국제 협력에 참여한 HIV-1에 감염된 아프리카 혈통의 3,879명을 대상으로 설정점 바이러스 부하 제어의 유전적 결정 요인을 평가했습니다. HIV3. 우리는 이전에 설명되지 않은 염색체 1에서 피크 변형이 작은 대립 유전자 복사본당 더 낮은 설정점 바이러스 로드당 ml당 약 0.3 log10 변환 복사본과 연관되고 아프리카 출신 인구에 특정한 연관 신호를 식별합니다. 가장 관련이 있는 변종은 유전자간이며 긴 유전자간 비암호화 RNA(LINC00624)와 DNA 복구에 관여하는 헬리카제를 암호화하는 코딩 유전자 CHD1L 사이에 있습니다4. iPS 세포 유래 대식세포 및 기타 불멸화 세포주에서의 감염 분석에서는 CHD1L 녹다운 및 CHD1L 녹아웃 세포에서 HIV-1 복제가 증가한 것으로 나타났습니다. 우리는 CHD1L 근처의 아프리카 특유의 유전적 변이가 생체 내에서 HIV 복제와 연관되어 있다는 인구 유전학 연구의 증거를 제공합니다. 실험적 연구에 따르면 CHD1L이 시험관 내 일부 세포 유형에서 HIV 감염을 제한할 수 있는 것으로 나타났지만, CHD1L이 생체 내에서 HIV 확산에 미치는 잠재적인 간접적 효과를 포함하여 세포 기반 분석으로는 확인할 수 없는 관찰의 기본 메커니즘을 이해하려면 추가 조사가 필요합니다. 요약하다.

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개인 수준의 유전형 분석 데이터에 대한 접근은 요청 시 얻을 수 있는 ICGH 협력 계약([email protected])에 서명하여 ICGH(International Collaboration for the Genomics of HIV)에 가입한 기관의 연구자로 제한됩니다. 모든 연구 참가자의 HIV 진단은 매우 민감한 특성으로 인해 잠재적인 재식별과 관련된 위험이 IRB에 의해 매우 높은 것으로 간주되어 개인 수준 데이터의 광범위한 공유를 방해했습니다. GWAS 요약 통계는 인간 게놈 전체 연관 연구의 NHGRI-EBI 카탈로그(https://www.ebi.ac.uk/gwas/home)에 수탁 번호 GCST90269914로 기탁되어 있습니다. RNA-seq 데이터는 NCBI(PRJEB18581)에서 확인할 수 있으며 eQTL 결과는 GitHub(https://github.com/smontgomlab/AFGR)에서 확인할 수 있습니다.

UNAIDS 데이터 2021(UNAIDS, 2021); https://www.unaids.org/en/resources/documents/2021/2021_unaids_data.

Gurdasani, D., Barroso, I., Zeggini, E. & Sandhu, MS 전 세계적으로 다양한 인구 집단의 질병 위험 유전체학. Nat. Genet 목사. 20, 520–535(2019).

기사 CAS PubMed Google 학술검색

맥라렌, PJ 외. 6,300명의 감염된 사례와 7,200명의 대조군에서 일반적인 유전적 변이와 HIV-1 획득에 대한 연관성 연구. PLoS Pathog. 9, e1003515(2013).

기사 CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Ahel, D.et al. 염색질 리모델링 효소 ALC1에 의한 DNA 복구의 폴리(ADP-리보스) 의존적 조절. 과학 325, 1240-1243(2009).

기사 ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

예방 격차 보고서(UNAIDS, 2016).

Mellors, JWet al. 혈장 내 HIV-1 RNA의 정량은 혈청전환 후 결과를 예측합니다. 앤. 인턴. 메드. 122, 573-579(1995).